Незважаючи на те що подорожник називають найбезпечнішим серед рослин, у нього є і протипоказання. Препарати на його основі забороняють використовувати при загостренні захворювань шлунково-кишкового тракту. листя подорожника потрібно замінити насінням цієї ж рослини при гастриті з підвищеною кислотністю.